Киборг 009 и войны монстров

Киборги, бежавшие от Черного Призрака, теперь разъехались по разным странам и стараются вести спокойную жизнь. Всё меняется, когда по городам начинают прокатываться атаки: неизвестное существо, напоминающее динозавра, использует мощные звуковые волны, чтобы разрушать здания и пугать людей. Доктор Исаак Гилмор подозревает, что за этим стоит всё тот же Черный Призрак, и решает вновь собрать команду киборгов.

Группу возглавляет Джо Шимамура, которого все знают как Киборга 009. К ним присоединяется Хелена — загадочная девушка, потерявшая семью из-за нападения монстра. Вместе они садятся на «Дельфин», специальный подводный самолёт, оснащённый защитой от ультразвуковых атак и дополнительными средствами борьбы. Команда отправляется на поиски чудовища и пытается выяснить, где теперь скрывается Черный Призрак.